Index

A

addObs() (conesToolBox.conesClasses.conesRegion.conesRegion method)

anomaly() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method)

C

calculateInflation() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) cones_count_netcdf_obs() (in module conesToolBox.conesFunctions) cones_get_netcdf_obs_coord() (in module conesToolBox.conesFunctions) cones_get_netcdf_obs_var() (in module conesToolBox.conesFunctions) cones_get_netcdf_var() (in module conesToolBox.conesFunctions) cones_live_plot() (in module conesToolBox.conesFunctions) cones_open_netcdf_dataset() (in module conesToolBox.conesFunctions) cones_prior_digest() (in module conesToolBox.conesFunctions) cones_run_id() (in module conesToolBox.conesFunctions) cones_write_prior_block() (in module conesToolBox.conesFunctions) cones_write_run_header() (in module conesToolBox.conesFunctions) conesAlgorithmMismatch conesEnKF (class in conesToolBox.conesClasses.conesEnKF) conesEnsembleSizeError conesKalmanGainInversionError conesMFEnKF (class in conesToolBox.conesClasses.conesMFEnKF) conesMFRegion (class in conesToolBox.conesClasses.conesMFRegion) conesMGEnKF (class in conesToolBox.conesClasses.conesMGEnKF) conesMGRegion (class in conesToolBox.conesClasses.conesMGRegion) conesParams (class in conesToolBox.conesClasses.conesParams) conesPathNotFound conesProfiler (class in conesToolBox.conesClasses.conesProfiler) conesRegion (class in conesToolBox.conesClasses.conesRegion)

conesStaticObservation (class in conesToolBox.conesClasses.conesObservation) conesToolBox.conesClasses.conesEnKF module conesToolBox.conesClasses.conesMFEnKF module conesToolBox.conesClasses.conesMFRegion module conesToolBox.conesClasses.conesMGEnKF module conesToolBox.conesClasses.conesMGRegion module conesToolBox.conesClasses.conesObservation module conesToolBox.conesClasses.conesParams module conesToolBox.conesClasses.conesProfiler module conesToolBox.conesClasses.conesRegion module conesToolBox.conesErrors module conesToolBox.conesFunctions module convergence_criteria() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method)

D

dump_error_convergence() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method)

dump_params_convergence() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method)

F

filterSampling() (conesToolBox.conesClasses.conesRegion.conesRegion method) filterSamplingAncillaryProj() (conesToolBox.conesClasses.conesMFRegion.conesMFRegion method) filterSamplingControlProj() (conesToolBox.conesClasses.conesMFRegion.conesMFRegion method) filterSamplingFine() (conesToolBox.conesClasses.conesMGRegion.conesMGRegion method) filterState() (conesToolBox.conesClasses.conesRegion.conesRegion method)

filterStateAncillaryProj() (conesToolBox.conesClasses.conesMFRegion.conesMFRegion method) filterStateControlProj() (conesToolBox.conesClasses.conesMFRegion.conesMFRegion method) filterStateFine() (conesToolBox.conesClasses.conesMGRegion.conesMGRegion method) full_report() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) (conesToolBox.conesClasses.conesRegion.conesRegion method)

G

get_coordinates_from_netcdf() (conesToolBox.conesClasses.conesObservation.conesStaticObservation method) get_obs2Obs_distance_matrix() (conesToolBox.conesClasses.conesRegion.conesRegion method) get_state2Obs_distance_matrix() (conesToolBox.conesClasses.conesRegion.conesRegion method)

get_time_from_netcdf() (conesToolBox.conesClasses.conesObservation.conesStaticObservation method) get_vars_from_netcdf() (conesToolBox.conesClasses.conesObservation.conesStaticObservation method) global2Local() (in module conesToolBox.conesFunctions)

I

inflateParams() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method)

inflateState() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) is_cell_set() (in module conesToolBox.conesFunctions)

K

KalmanGain() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method)

KalmanGainTotal() (conesToolBox.conesClasses.conesMFEnKF.conesMFEnKF method)

L

local2Global() (in module conesToolBox.conesFunctions)

M

matrix_to_txt() (in module conesToolBox.conesFunctions) mergeClips() (in module conesToolBox.conesFunctions) mergeUpdate() (conesToolBox.conesClasses.conesMGEnKF.conesMGEnKF method) module conesToolBox.conesClasses.conesEnKF conesToolBox.conesClasses.conesMFEnKF conesToolBox.conesClasses.conesMFRegion conesToolBox.conesClasses.conesMGEnKF conesToolBox.conesClasses.conesMGRegion conesToolBox.conesClasses.conesObservation conesToolBox.conesClasses.conesParams conesToolBox.conesClasses.conesProfiler conesToolBox.conesClasses.conesRegion conesToolBox.conesErrors conesToolBox.conesFunctions

O

obsNotInClippingsError

P

printCones() (in module conesToolBox.conesFunctions)

R

recenter_total() (conesToolBox.conesClasses.conesMFEnKF.conesMFEnKF method) region_rng() (in module conesToolBox.conesClasses.conesEnKF)

report() (conesToolBox.conesClasses.conesObservation.conesStaticObservation method) (conesToolBox.conesClasses.conesRegion.conesRegion method) reset_cycle() (conesToolBox.conesClasses.conesProfiler.conesProfiler method)

S

save_to_csv() (conesToolBox.conesClasses.conesProfiler.conesProfiler method) set_cells_coordinates() (conesToolBox.conesClasses.conesRegion.conesRegion method) set_current_time() (conesToolBox.conesClasses.conesRegion.conesRegion method) set_current_time_index() (conesToolBox.conesClasses.conesObservation.conesStaticObservation method) set_file() (conesToolBox.conesClasses.conesObservation.conesStaticObservation method) set_global_cell() (conesToolBox.conesClasses.conesObservation.conesStaticObservation method) set_id() (conesToolBox.conesClasses.conesObservation.conesStaticObservation method) set_local_cell() (conesToolBox.conesClasses.conesObservation.conesStaticObservation method) set_obs_stats() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) set_R() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) set_ranks() (conesToolBox.conesClasses.conesObservation.conesStaticObservation method) set_x_anomaly() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) set_y_matrix() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) setDStateAncillaryProj() (conesToolBox.conesClasses.conesMFRegion.conesMFRegion method) setH() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) setInflation() (conesToolBox.conesClasses.conesRegion.conesRegion method) setL() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) setObs() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) setObsSettings() (conesToolBox.conesClasses.conesRegion.conesRegion method)

setParamFine() (conesToolBox.conesClasses.conesMGRegion.conesMGRegion method) setParams() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) (conesToolBox.conesClasses.conesRegion.conesRegion method) setParamsAncillaryProj() (conesToolBox.conesClasses.conesMFRegion.conesMFRegion method) setParamsControlProj() (conesToolBox.conesClasses.conesMFRegion.conesMFRegion method) setRanks() (conesToolBox.conesClasses.conesRegion.conesRegion method) setSampling() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) setState() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) (conesToolBox.conesClasses.conesRegion.conesRegion method) setStateAncillaryProj() (conesToolBox.conesClasses.conesMFRegion.conesMFRegion method) setStateControlProj() (conesToolBox.conesClasses.conesMFRegion.conesMFRegion method) setStateFine() (conesToolBox.conesClasses.conesMGRegion.conesMGRegion method) small_mgenkf_report() (conesToolBox.conesClasses.conesMGEnKF.conesMGEnKF method) small_report() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) splitDStateAncillaryProj() (conesToolBox.conesClasses.conesMFRegion.conesMFRegion method) splitState() (conesToolBox.conesClasses.conesRegion.conesRegion method) splitStateAncillaryProj() (conesToolBox.conesClasses.conesMFRegion.conesMFRegion method) splitStateControlProj() (conesToolBox.conesClasses.conesMFRegion.conesMFRegion method) start() (conesToolBox.conesClasses.conesProfiler.conesProfiler method) stop() (conesToolBox.conesClasses.conesProfiler.conesProfiler method)

U

update() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) update_background() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) updateFine() (conesToolBox.conesClasses.conesMGEnKF.conesMGEnKF method) updateParams() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) updateParamsAncillaryProj() (conesToolBox.conesClasses.conesMFEnKF.conesMFEnKF method) updateParamsControlProj() (conesToolBox.conesClasses.conesMFEnKF.conesMFEnKF method)

updateParamsFine() (conesToolBox.conesClasses.conesMGEnKF.conesMGEnKF method) updateState() (conesToolBox.conesClasses.conesEnKF.conesEnKF method) updateStateAncillaryProj() (conesToolBox.conesClasses.conesMFEnKF.conesMFEnKF method) updateStateControlProj() (conesToolBox.conesClasses.conesMFEnKF.conesMFEnKF method) updateStateFine() (conesToolBox.conesClasses.conesMGEnKF.conesMGEnKF method) updateTotal() (conesToolBox.conesClasses.conesMFEnKF.conesMFEnKF method)